Die zum Fotolabor umgerüstete Waschküche im Hauptmenü dient als Basis für die Sondereinsätze. Durch das Absolvieren von Missionen erhalten die Spieler gelegentlich Fotos mit Hinweisen, die wiederum Sondereinsätze freischalten. Diese bestehen aus mehreren aufeinanderfolgenden Kämpfen und können jederzeit über die Waschküche begonnen oder fortgeführt werden. Das Besondere an den Sondereinsätzen ist, dass sie keine Energie verbrauchen und die Kämpfer für Recht und Ordnung sofort zur Heldentat schreiten können. Jeder gewonnene Kampf bringt die Helden Schritt für Schritt dem erfolgreichen Abschluss eines Sondereinsatzes näher, doch wenn man verliert, müssen in einer erholsamen Ruhepause zunächst neue Kräfte gesammelt werden. Hat man einen Sondereinsatz beendet, kann dieser im neuen Spezialmodus erneut gespielt werden, um immer bessere Ergebnisse zu erzielen.

Am Ende eines jeden Sondereinsatzes steht ein schweißtreibender Kampf gegen einen hartnäckigen Bossgegner an, der ganz besondere Belohnungen für die siegreichen Helden bereithält.

Helden, die Pflicht ruft! Lasst euch diese spannenden Sondereinsätze nicht entgehen!

Wer also schon immer davon geträumt hat, als Superheld die Welt vor dem Bösen zu bewahren, kann sich auf der offiziellen Hero Zero Webseite direkt selbst ins Heldenleben stürzen.